Besondere Prunkstücke im Kuppelraum sind die reichgeschnitzten Chorstühle, die von den beiden Chororgeln bekrönt werden.

Die heutige Institutskirche besteht aus einem 1715 bis 1718 von Jakob Prandtauer errichteten Zentralbau (ursprüngliche Institutskapelle) und einem westlich anschließenden, von 1767 bis 1769 wahrscheinlich von Matthias Munggenast errichteten zentralen Erweiterungsbau. Fresken von Paul Troger und Bartolomeo Altomonte; Ausstattung u. a. von Peter Widerin (Skulpturen) und Karl Reslfeld (Gemälde).

Eine wunderschöne Anlage bilden die Bauten des Ensembles, weitläufige historische Eleganz in traumhafter Umgebung. Die malerische Stiftskirche ist von zahlreichen historisch interessierten Gebäuden umgeben, zum Beispiel der gotischen Heilig-Geist-Kapelle mit dem einzigen stilecht erhaltenen Karner im gesamten Braunauer Bezirk.