Ebenso bunt, wie die Palette der Landschaften ist die ungeheuer arten- und formenreiche Flora und Fauna, die hier lebt. Der naturkundliche Bereich des Landesmuseums Niederösterreich präsentiert diese Vielfalt und streicht Besonderheiten der Region heraus. Die Natur der Region kann entlang eines Weges, der vom Hochgebirge bis ins Tiefland und sogar unter die Erde in eine Schauhöhle führt erwandert werden.
Dabei kommen nicht nur traditionelle museale Präsentationstechniken wie Präparate und Modelle, sondern auch lebende Tiere zum Einsatz. Denn das Landesmuseum ist nicht nur ein Museum sondern auch ein Zoo. Lebende Fische, Amphibien und Reptilien machen die heimische Tierwelt im wahrsten Sinn des Wortes erlebbar. Die Nachzuchten, z.B. bei bedrohten Arten wie Sumpfschildkröte, Feuersalamander und Smaragdeidechse sind nicht nur Nachweis für die hohe Qualität der Tierhaltung. Sie tragen ganz wesentlich dazu bei, bei großen wie kleinen Museumsbesuchern Interesse zu wecken, Verständnis für aktuelle Fragen des Natur- und Umweltschutzes hervorzurufen und komplexe ökologische Zusammenhänge zu erläutern.